يُعتبر مشفى الأطفال هيئة تعليمية خدمية، حيث يتم فيه تدريب طلاب الطب والدراسات العليا والبورد العربي وتُعد فيه رسائل الدكتوراه في اختصاصات عديدة بالإضافة إلى طلاب وطالبات مدرسة التمريض والمعاهد الطبية التابعة لجامعة دمشق، ويُعتبر المشفى الوحيد المتخصص بأمراض الأطفال في سورية ويستقبل الأطفال والخدج من جميع المحافظات ويقدم الاستشارات الطبية والخدمات العلاجية.

الخدمات النوعية:

• التغذية الوريدية الخلالية T.P.N:

يعد قسم الأطفال القسم الأول الذي أدخل T.P.N  في عام 2008 حيث تطبق هذه التغذية وفق طرق ومعايير عالمية دقيقة وتقدر الحالات بـ 40-50 حالة سنوياً.

• تدبير حالات سوء التغذية الشديد SAM:

يعتبر قسم الأطفال هو الأول في سورية أدخل برنامج تطبيق تدبير سوء التغذية الشديد في المشافي وفق معايير W.H.O منذ 2000، وتم تعميم هذا البرنامج على أقسام الأطفال في مشافي وزارة الصحة وحالياً يستقبل القسم حالات سوء التغذية الشديد بمعدل 4- 6 حالات شهرياً مع نسب وفيات لا تزيد عن 7 % وهي أفضل نسب مسجلة عالمياً.

• قياس حموضة المري:

أدخل قسم الأطفال ولأول مرة في وزارة الصحة جهاز قياس حموضة المري وذلك لتشخيص حالات القلس المعدي المرئي منذ عام 2001 ويجري سنوياً ما يقارب 30 حالة في القسم.

• التنفس الصناعي الآلي:

يحتوي قسم الأطفال في وحدتي الحواضن ووحدة أسرة مهد وعناية الأطفال على أجهزة التهوية الآلية حيث تطبق التهوية الآلية في حالات القصور التنفسي وحالات توقف القلب والتنفس.
حيث بلغت نسبة الفطام خلال السنوات الماضية أكثر من 50% من الحالات في عناية الأطفال.

• خدمة التهوية الآلية الغازية عبر الأنف (CPAP ):

تستقبل وحدة الحواضن وأسرة المهد الحالات الخطرة للقصور التنفسي البسيط حيث تقدم خدمة CPAP والتي تساعد في إنقاص نسبة الأمراض والمواتية إلى حوالي 25% من الحالات المهددة بالحياة.

• تم إدخال جهاز فصادة البلازما الذي يفيد في تدبير مرض غيلان باريه ومرضى المنجلي وإصابة الكلية بالذأب الحمامي الجهازي ومرضى النشأ القاعدي ومرضى زرع الكلية والمتلازمة اليوريميائية الانحلالية وبعض الأمراض المناعية والدموية الأخرى.
• يتم العمل على إنجاز العديد من المشاريع، ومنها: مشروع أتمتة أعمال المستشفى، مشروع مركزي زرع النقي وجراحة القلب عند الأطفال.